O desempenho de Lula na Bahia foi o segundo melhor de todo o país, atrás apenas do estado do Piauí, que teve 76,84%. Lula venceu em 415 dos 417 municípios baianos. Ele perdeu em apenas duas cidades, as mesmas onde havia perdido no primeiro turno, em Luís Eduardo Magalhães, no oeste da Bahia, e em Buerarema, no baixo sul do estado.
Também no segundo turno, a Bahia teve um abstenção geral de 20,49%, com 2 milhões e 310 mil eleitores que deixaram de votar. Votos brancos totalizaram 1,26% (113.101) e nulos 4,06% (363.656).